Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NRDE2Q9H7Z3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms