Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM15Q9C019 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms