Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
YTHDF1Q9BYJ9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms