Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms