Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHMP4AQ9BY43 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms