Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTA3Q9BTC8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTA3Q9BTC8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTA3Q9BTC8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTA3Q9BTC8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTA3Q9BTC8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTA3Q9BTC8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTA3Q9BTC8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTA3Q9BTC8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTA3Q9BTC8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms