Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MESP1Q9BRJ9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms