Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms