Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOPXQ9BPY8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms