Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms