Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RBBP8Q99708 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms