Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIN3AQ96ST3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIN3AQ96ST3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms