Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFT140Q96RY7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms