Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms