Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBPF4Q96M43 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF4Q96M43 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms