Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C18orf8Q96DM3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms