Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMD3Q96D46 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms