Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC1Q96C34 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms