Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms