Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRG4Q92954 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms