Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRNP3Q8WYN3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRNP3Q8WYN3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms