Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
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CNKSR2Q8WXI2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 CCT6P1-203ENST00000443108 1170 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 CKMT2-AS1-206ENST00000511495 585 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 LINC00520-206ENST00000560336 883 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
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CNKSR2Q8WXI2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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CNKSR2Q8WXI2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
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CNKSR2Q8WXI2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC105202.1-203ENST00000518024 875 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC244131.1-201ENST00000542152 922 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNKSR2Q8WXI2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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