Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHIPQ8WWQ0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHIPQ8WWQ0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms