Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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