Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms