Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF550Q7Z398 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms