Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP53Q70EK8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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USP53Q70EK8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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USP53Q70EK8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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USP53Q70EK8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
USP53Q70EK8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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