Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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