Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms