Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUSD1Q6UWL2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms