Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms