Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GDF6Q6KF10 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GDF6Q6KF10 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms