Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KHDC3LQ587J8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms