Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWISTNBQ3B726 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWISTNBQ3B726 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms