Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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NDUFA9Q16795 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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