Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms