Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CTF1Q16619 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CTF1Q16619 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CTF1Q16619 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTF1Q16619 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTF1Q16619 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTF1Q16619 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTF1Q16619 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTF1Q16619 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTF1Q16619 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CTF1Q16619 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CTF1Q16619 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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