Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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