Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HLFQ16534 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HLFQ16534 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HLFQ16534 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HLFQ16534 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLFQ16534 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms