Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCD2Q16342 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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