Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS72Q15906 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS72Q15906 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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