Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SYCP1Q15431 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SYCP1Q15431 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SYCP1Q15431 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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SYCP1Q15431 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYCP1Q15431 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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SYCP1Q15431 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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