Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRKQ15262 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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