Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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