Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EEA1Q15075 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
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