Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME4Q14997 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms