Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCARF1Q14162 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCARF1Q14162 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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