Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAPSQ13938 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CAPSQ13938 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms