Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBB2AQ13885 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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