Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DDX39BQ13838 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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DDX39BQ13838 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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DDX39BQ13838 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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DDX39BQ13838 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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DDX39BQ13838 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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DDX39BQ13838 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DDX39BQ13838 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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